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Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8
PEF1, Peflin, human
Known RBP
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284 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
PEF1
Q9UBV8
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108 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU6-1201P-201
ENST00000384227
107 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU6-154P-201
ENST00000384306
106 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
MIR624-201
ENST00000385217
97 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU4-43P-201
ENST00000410628
137 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU6-175P-201
ENST00000516896
107 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.804-201
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-0.73
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.26-201
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101 nt
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.84-201
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
MIR539-201
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78 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
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BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
AL121914.1-201
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
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BASIC
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PEF1
Q9UBV8
RNU6-1338P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU5B-6P-201
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.44-201
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108 nt
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
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70 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.225-201
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97 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
SNORD114-17-201
ENST00000364699
75 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.395-201
ENST00000383945
109 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.619-201
ENST00000410951
90 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
AL353795.2-201
ENST00000431804
425 nt
TSL 2
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
MTND5P22-201
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195 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
SNORD2.1-201
ENST00000458762
69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
MTND5P40-201
ENST00000559945
246 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
MIR369-201
ENST00000362155
70 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.64-201
ENST00000362845
102 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.210-201
ENST00000364161
110 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU4-17P-201
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141 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU6-524P-201
ENST00000384270
107 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU6-1321P-201
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107 nt
BASIC
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PEF1
Q9UBV8
RNU6-1250P-201
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107 nt
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU6-651P-201
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105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
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BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
snoU13.13-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.809-201
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BASIC
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□□□□□ -2.53
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Q9UBV8
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BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
RNU6-1247P-201
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Q9UBV8
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TSL 5
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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PEF1
Q9UBV8
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Q9UBV8
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112 nt
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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BASIC
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Q9UBV8
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
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BASIC
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□□□□□ -2.53
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Q9UBV8
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PEF1
Q9UBV8
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BASIC
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□□□□□ -2.53
PEF1
Q9UBV8
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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Q9UBV8
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PEF1
Q9UBV8
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BASIC
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PEF1
Q9UBV8
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106 nt
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PEF1
Q9UBV8
MIR335-201
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BASIC
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
RNU6-228P-201
ENST00000362700
106 nt
BASIC
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PEF1
Q9UBV8
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102 nt
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.92-201
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102 nt
BASIC
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PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.235-201
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PEF1
Q9UBV8
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PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.306-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.312-201
ENST00000365089
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.322-201
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102 nt
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
MIR548I2-201
ENST00000408348
149 nt
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
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BASIC
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.650-201
ENST00000459002
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
RNU6-118P-201
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PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.777-201
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□□□□□ -2.54
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Q9UBV8
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BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
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BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.789-201
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102 nt
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
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BASIC
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□□□□□ -2.54
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BASIC
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Q9UBV8
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
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109 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
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Q9UBV8
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85 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
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BASIC
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
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ENST00000618032
68 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
RNU6-1233P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
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ENST00000363109
102 nt
BASIC
-0.81
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PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.247-201
ENST00000364500
92 nt
BASIC
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PEF1
Q9UBV8
Y_RNA.407-201
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113 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
PEF1
Q9UBV8
SNORA51.5-201
ENST00000384126
131 nt
BASIC
-0.81
□□□□□ -2.54
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