Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TIMMDC1Q9NPL8 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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