Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHSY3Q70JA7 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CHSY3Q70JA7 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CHSY3Q70JA7 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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CHSY3Q70JA7 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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CHSY3Q70JA7 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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CHSY3Q70JA7 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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CHSY3Q70JA7 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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CHSY3Q70JA7 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHSY3Q70JA7 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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