Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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PTPRNQ16849 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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PTPRNQ16849 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPRNQ16849 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRNQ16849 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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PTPRNQ16849 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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PTPRNQ16849 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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PTPRNQ16849 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRNQ16849 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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PTPRNQ16849 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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PTPRNQ16849 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRNQ16849 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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