Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FXNQ16595 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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FXNQ16595 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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FXNQ16595 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FXNQ16595 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
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FXNQ16595 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FXNQ16595 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FXNQ16595 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FXNQ16595 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
FXNQ16595 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FXNQ16595 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FXNQ16595 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
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FXNQ16595 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FXNQ16595 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FXNQ16595 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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FXNQ16595 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FXNQ16595 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FXNQ16595 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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FXNQ16595 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FXNQ16595 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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FXNQ16595 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FXNQ16595 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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FXNQ16595 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
FXNQ16595 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FXNQ16595 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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FXNQ16595 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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FXNQ16595 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FXNQ16595 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FXNQ16595 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FXNQ16595 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FXNQ16595 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FXNQ16595 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FXNQ16595 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FXNQ16595 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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