Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
MKRN3Q13064 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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