Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ECHS1P30084 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ECHS1P30084 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ECHS1P30084 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms