Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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VAX2Q9UIW0 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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VAX2Q9UIW0 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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VAX2Q9UIW0 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
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VAX2Q9UIW0 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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VAX2Q9UIW0 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAX2Q9UIW0 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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