Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RTN1Q16799 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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RTN1Q16799 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTN1Q16799 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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RTN1Q16799 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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RTN1Q16799 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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RTN1Q16799 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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RTN1Q16799 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
RTN1Q16799 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RTN1Q16799 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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