Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD1Q16676 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FOXD1Q16676 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD1Q16676 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD1Q16676 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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