Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
VPS72Q15906 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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