Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRDP23468 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
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PTPRDP23468 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
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PTPRDP23468 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
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PTPRDP23468 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRDP23468 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
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