Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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HERPUD2Q9BSE4 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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HERPUD2Q9BSE4 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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HERPUD2Q9BSE4 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERPUD2Q9BSE4 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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