Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SPOCK3Q9BQ16 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SPOCK3Q9BQ16 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SPOCK3Q9BQ16 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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