Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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