Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SEC23AQ15436 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SEC23AQ15436 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SEC23AQ15436 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192 ms