Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CACNA1CQ13936 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms