Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMAD4Q13485 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMAD4Q13485 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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