Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2BQ13224 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2BQ13224 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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