Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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IFT88Q13099 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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IFT88Q13099 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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IFT88Q13099 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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IFT88Q13099 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
IFT88Q13099 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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IFT88Q13099 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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IFT88Q13099 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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IFT88Q13099 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
IFT88Q13099 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
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