Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
MKRN3Q13064 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN3Q13064 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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