Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPN13Q12923 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPN13Q12923 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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