Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SPOCK3Q9BQ16 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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