Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXD1Q16676 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXD1Q16676 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD1Q16676 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD1Q16676 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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