Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CDKN3Q16667 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CDKN3Q16667 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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