Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SMN1Q16637 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SMN1Q16637 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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