Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TLR1Q15399 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TLR1Q15399 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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