Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NR1I3Q14994 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NR1I3Q14994 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NR1I3Q14994 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.2 ms