Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHD4Q14839 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.6 ms