Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
COL9A3Q14050 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL9A3Q14050 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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