Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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CKAP5Q14008 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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CKAP5Q14008 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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CKAP5Q14008 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CKAP5Q14008 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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