Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMPOP42166 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMPOP42166 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMPOP42166 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMPOP42166 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMPOP42166 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMPOP42166 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMPOP42166 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMPOP42166 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMPOP42166 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMPOP42166 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
TMPOP42166 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
TMPOP42166 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMPOP42166 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMPOP42166 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMPOP42166 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMPOP42166 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMPOP42166 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMPOP42166 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMPOP42166 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMPOP42166 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMPOP42166 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
TMPOP42166 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMPOP42166 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMPOP42166 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMPOP42166 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMPOP42166 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMPOP42166 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMPOP42166 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMPOP42166 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMPOP42166 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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