Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SH3BP5O60239 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SH3BP5O60239 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SH3BP5O60239 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.3 ms