Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TIMMDC1Q9NPL8 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms