Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.6 ms