Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZBED3Q96IU2 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ZBED3Q96IU2 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms