Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CCDC47Q96A33 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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