Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KNOP1Q1ED39 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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