Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPROQ16827 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPROQ16827 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPROQ16827 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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