Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RTN1Q16799 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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RTN1Q16799 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
RTN1Q16799 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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