Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
RPE65Q16518 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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RPE65Q16518 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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RPE65Q16518 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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RPE65Q16518 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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RPE65Q16518 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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RPE65Q16518 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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