Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC85BQ15834 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC85BQ15834 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC85BQ15834 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC85BQ15834 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC85BQ15834 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC85BQ15834 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC85BQ15834 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC85BQ15834 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC85BQ15834 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC85BQ15834 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms