Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
BRD3Q15059 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
BRD3Q15059 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
BRD3Q15059 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
BRD3Q15059 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
BRD3Q15059 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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BRD3Q15059 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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BRD3Q15059 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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BRD3Q15059 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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BRD3Q15059 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
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BRD3Q15059 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
BRD3Q15059 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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BRD3Q15059 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
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BRD3Q15059 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BRD3Q15059 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BRD3Q15059 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BRD3Q15059 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
BRD3Q15059 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BRD3Q15059 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BRD3Q15059 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
BRD3Q15059 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BRD3Q15059 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
BRD3Q15059 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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