Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
CKAP5Q14008 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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CKAP5Q14008 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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CKAP5Q14008 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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CKAP5Q14008 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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CKAP5Q14008 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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CKAP5Q14008 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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CKAP5Q14008 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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CKAP5Q14008 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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CKAP5Q14008 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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CKAP5Q14008 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
CKAP5Q14008 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CKAP5Q14008 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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