Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PKP1Q13835 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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PKP1Q13835 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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PKP1Q13835 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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PKP1Q13835 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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PKP1Q13835 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PKP1Q13835 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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