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Protein–RNA interactions for Protein: Q13620
CUL4B, Cullin-4B, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4B
Q13620
RNU6-1100P-201
ENST00000410691
104 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-860P-201
ENST00000410860
104 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-1217P-201
ENST00000411276
104 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-785P-201
ENST00000411324
104 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RPL39P25-201
ENST00000449384
154 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC141846.1-201
ENST00000568348
142 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
U6.90-201
ENST00000614007
104 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
U6.70-201
ENST00000620287
104 nt
BASIC
0.83
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-151P-201
ENST00000364158
107 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
SNORA18-201
ENST00000384416
132 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
MIR520H-201
ENST00000385126
88 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
PCNPP3-201
ENST00000393579
471 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6ATAC42P-201
ENST00000408637
95 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC244098.3-201
ENST00000424803
96 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU7-113P-201
ENST00000459273
62 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC133485.4-201
ENST00000561835
220 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC138907.4-201
ENST00000570107
226 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
MIR4452-201
ENST00000583004
71 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
MIR4305-201
ENST00000583252
102 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
SNORD92-201
ENST00000585078
85 nt
BASIC
0.82
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
HSBP1P2-201
ENST00000299671
229 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
SNORD114-22-201
ENST00000365423
72 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-949P-201
ENST00000384040
107 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-364P-201
ENST00000384387
107 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
MIR573-201
ENST00000384964
99 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
MIR605-201
ENST00000385078
83 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
MIR513C-201
ENST00000401352
84 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC015818.7-201
ENST00000428754
109 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC087499.7-201
ENST00000441958
109 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
Y_RNA.690-201
ENST00000516603
95 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-1258P-201
ENST00000516911
111 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC011195.1-201
ENST00000578177
177 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
MIR3144-201
ENST00000579460
79 nt
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
ZNF518A-209
ENST00000614149
7911 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.81
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
Y_RNA.150-201
ENST00000363562
102 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
Y_RNA.171-201
ENST00000363760
102 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU4-45P-201
ENST00000365469
141 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RPS27-201
ENST00000368567
350 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
SNORD116-18-201
ENST00000383961
92 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
SNORD93-201
ENST00000408813
74 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC004941.2-201
ENST00000427009
228 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU7-197P-201
ENST00000458836
62 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU7-156P-201
ENST00000517214
74 nt
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC007991.2-201
ENST00000520185
102 nt
TSL 5
BASIC
0.8
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-1130P-201
ENST00000365434
107 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AL606490.4-201
ENST00000423117
127 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-240P-201
ENST00000516098
97 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU7-35P-201
ENST00000517174
62 nt
BASIC
0.79
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
CCDC73-201
ENST00000335185
3849 nt
APPRIS P2
TSL 2
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNY1P11-201
ENST00000363759
113 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNU6-342P-201
ENST00000384521
104 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
Y_RNA.531-201
ENST00000384589
121 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
Y_RNA.651-201
ENST00000459380
103 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
RNA5SP33-201
ENST00000516687
98 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
IGHVII-40-1-201
ENST00000517316
58 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC004812.1-201
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146 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC090897.1-201
ENST00000580909
226 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
AC021443.1-201
ENST00000604478
211 nt
BASIC
0.78
□□□□□ -2.28
CUL4B
Q13620
Y_RNA.180-201
ENST00000363867
113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU6-309P-201
ENST00000364573
106 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.400-201
ENST00000383963
111 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.464-201
ENST00000384282
110 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU6-804P-201
ENST00000384286
107 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
MIR520E-201
ENST00000384867
87 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
U8.15-201
ENST00000390947
134 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU7-102P-201
ENST00000458948
62 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
COX6CP6-201
ENST00000490840
228 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU7-79P-201
ENST00000516082
62 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.686-201
ENST00000516548
134 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
MIR548X2-201
ENST00000579776
100 nt
BASIC
0.77
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.299-201
ENST00000364973
94 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNY1P13-201
ENST00000365030
105 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.470-201
ENST00000384307
117 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU4-83P-201
ENST00000410863
133 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RPS29P1-201
ENST00000465274
159 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU2-35P-201
ENST00000516446
142 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
AL078603.1-201
ENST00000603824
313 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
AP001340.1-201
ENST00000624405
217 nt
BASIC
0.76
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.398-201
ENST00000383952
99 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
AL512326.2-201
ENST00000426359
151 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU7-164P-201
ENST00000459221
62 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.692-201
ENST00000516627
105 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
MIR6835-201
ENST00000621552
64 nt
BASIC
0.75
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
SNORD100-201
ENST00000408573
76 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNA5SP222-201
ENST00000411039
105 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
AP003327.1-201
ENST00000529684
127 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
MIR3121-201
ENST00000579680
77 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
MIR3668-201
ENST00000582138
75 nt
BASIC
0.74
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.8-201
ENST00000362353
102 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.42-201
ENST00000362660
108 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
Y_RNA.298-201
ENST00000364960
107 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU6-765P-201
ENST00000516916
99 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU6-1212P-201
ENST00000517023
104 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
RNU6-448P-201
ENST00000517052
107 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
MIR3612-201
ENST00000579753
87 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
AC008608.1-201
ENST00000603910
127 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
AL590095.2-201
ENST00000604136
117 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
AL137067.1-201
ENST00000615933
120 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
MIR8066-201
ENST00000617280
78 nt
BASIC
0.73
□□□□□ -2.29
CUL4B
Q13620
AC108866.1-201
ENST00000503073
2339 nt
TSL 5
BASIC
0.72
□□□□□ -2.29
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