Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms