Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EAF1Q96JC9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms