Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRG4Q92954 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRG4Q92954 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms