Protein–RNA interactions for Protein: Q86WU2

LDHD, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHDQ86WU2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LDHDQ86WU2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LDHDQ86WU2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms